finally got subsurface rotating gif working in docs ☸☸☸

stephmshields · Jun 19, 2018 · de80ecd · de80ecd
1 parent b4c2807
commit de80ecd
Show file tree

Hide file tree

Showing 2 changed files with 17 additions and 9 deletions.
diff --git a/...s/surface_analyses/example_subsurface.gif → docs/example_subsurface.gif b/...s/surface_analyses/example_subsurface.gif → docs/example_subsurface.gif
diff --git a/examples/surface_analyses/plot_subsurfaces.py b/examples/surface_analyses/plot_subsurfaces.py
@@ -7,6 +7,8 @@
 
 """
 
+import tempfile
+
 import matplotlib.pyplot as plt
 import numpy as np
 
@@ -19,7 +21,7 @@
 left_surface = cortex.polyutils.Surface(left[0], left[1])
 right_surface = cortex.polyutils.Surface(right[0], right[1])
 
-##########################################################
+################################################################################
 # create subsurface
 
 center = 125000
@@ -28,7 +30,7 @@
 patch = left_surface.get_geodesic_patch(center, radius=radius)
 subsurface = left_surface.create_subsurface(vertex_mask=patch['vertex_mask'])
 
-##########################################################
+################################################################################
 # plot data on subsurface
 
 data = subsurface.geodesic_distance([0]) + 20
@@ -37,17 +39,23 @@
 plt.title('example subsurface data')
 plt.show()
 
-##########################################################
+################################################################################
 # plot subsurface as gif
-# .. image:: ../../surface_analyses/example_subsurface.gif
+#
 
-pass
-# f, path = tempfile.mkstemp()
-# path = path + '.gif'
+f, path = tempfile.mkstemp()
+path = path + '.gif'
 # subsurface.plot_subsurface_rotating_gif(path=path)
 
-##########################################################
+
+################################################################################
+# .. image:: ../../example_subsurface.gif
+
+
+################################################################################
 # create many patches
+#
+
 
 patches = left_surface.get_geodesic_patches(
     seeds=np.arange(0, 150000, 1000),
@@ -65,7 +73,7 @@
 plt.title('patches')
 plt.show()
 
-##########################################################
+################################################################################
 # create geodesic strip patch
 
 patch = left_surface.get_geodesic_strip_patch(v0=70000, v1=125000, radius=5)